एनसीडीसी की महापरिषद, प्रबंधन बोर्ड और प्रबंध निदेशक अपने-अपने स्तर पर निर्णयों की जाँच और अंतिम रूप देने में सर्वोच्च प्राधिकारी के रूप में कार्य करते हैं। प्रत्येक संगठन के शासन और रणनीतिक दिशा में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। महापरिषद व्यापक मार्गदर्शन और नीतिगत ढाँचा प्रदान करती है, प्रबंधन बोर्ड प्रमुख पहलों के प्रभावी कार्यान्वयन और निगरानी को सुनिश्चित करता है, और प्रबंध निदेशक को संगठन के उद्देश्यों के अनुरूप निर्णयों को क्रियान्वित और कार्यान्वित करने हेतु व्यापक प्रशासनिक शक्तियाँ प्रदान की जाती हैं। प्रबंध निदेशक को प्राप्त प्रशासनिक अधिकार, उच्च शासी निकायों द्वारा निर्धारित अधिदेश और निर्देशों के अनुसार, एनसीडीसी के दैनिक कार्यों के सुचारू और कुशल संचालन को सुनिश्चित करते हैं।